設(shè)計根據(jù)實驗場所提供的場地空間，設(shè)計微生物實驗區(qū)，以建筑面積為200平方米為例。應(yīng)設(shè)有一個主實驗室,一個一更緩沖間，一個二更緩沖間，一個洗刷消毒間。
設(shè)計充分利用現(xiàn)有的空間，根據(jù)國家相關(guān)規(guī)范和實驗場所的特殊要求進(jìn)行平面布置。考慮生物安全實驗室應(yīng)同時實施一級屏障和二級屏障的要求，其中一級屏障主要體現(xiàn)在微生物實驗區(qū)的平面布置和維護(hù)結(jié)構(gòu)方面，二級屏障主要體現(xiàn)在空調(diào)凈化系統(tǒng)方面。在平面布置方面把人流和物流分隔開，防止人和物的交叉感染：實驗操作人員通過一更緩沖間和二更緩沖間進(jìn)入P2主實驗室;實驗物體通過兩個互鎖式傳遞窗進(jìn)出主實驗室，其中一個互鎖式傳遞窗設(shè)在主實驗室和準(zhǔn)備間之間，另外一個設(shè)在主實驗室和洗刷消毒室之間，保證了潔凈物不受感染，同時保證了污染物盡快傳進(jìn)洗刷消毒室進(jìn)行消毒滅菌。
微生物實驗室的整個平面布局完全能夠滿足國家規(guī)范及標(biāo)準(zhǔn)和實驗場所最終要求，而且充分利用了實驗場所劃分的建筑空間，按照實驗室操作程序的要求配備了各種功能的房間，操作路線方便快捷，每間實驗室的平面尺寸都是按照各種實驗功能分配的。

分析領(lǐng)域的化學(xué)分析主要基于物質(zhì)對光的物理吸收和散射特性以及發(fā)射光的物理特性。主要儀器有原子發(fā)射光譜儀、原子吸收光譜儀、分光光度計、原子熒光光譜儀、熒光分光光度計、X射線熒光儀、紅外光譜儀、電感耦合等離子體（LCP）光譜儀、拉曼光譜儀等。實驗室應(yīng)盡量遠(yuǎn)離化學(xué)實驗室，防止酸、堿、腐蝕性氣體對儀器造成損壞，遠(yuǎn)離輻射源；室內(nèi)應(yīng)采取防塵、防震、防潮等措施。儀器平臺與窗戶和墻壁之間應(yīng)有一定的距離，以便于儀器的調(diào)試和維護(hù)。應(yīng)設(shè)計局部排氣。使用原子吸收罩排氣更合適。
樣品處理室可根據(jù)上述實驗室的實際需要設(shè)置，一般有洗滌臺、試驗臺、通風(fēng)柜等設(shè)備，與化學(xué)實驗室相似。
潔凈實驗室主要通過人工手段控制室內(nèi)空氣中的粉塵、細(xì)菌濃度、溫度、濕度和壓力，以達(dá)到所需的清潔度、溫度、濕度和氣流速度。空氣清潔度是指清潔空氣環(huán)境中的空氣粉塵含量，空氣清潔度的水平按粉塵濃度劃分。清潔度是指每升空氣中的粒徑≥0、5um我國空氣潔凈等級標(biāo)準(zhǔn)分為100級、1000級、10000級和10000級。國際標(biāo)準(zhǔn)分為1級、2級、3級、4級和5級。

在處理細(xì)菌時，由于污染嚴(yán)重，微生物實驗室設(shè)置了單個更衣室和緩沖室，而無菌檢查、微生物極限檢查和抗生素微生物檢定實驗室（公共更衣室和緩沖室）沒有嚴(yán)格分開。GMP檢驗中的2802項明確規(guī)定，生物檢定、微生物極限檢定和放射性同位素檢定應(yīng)在不同的房間進(jìn)行。解釋中提到無菌室和微生物極限室不允許使用公共更衣室和緩沖室，以防止無菌室污染。公共更衣室和緩沖室必然會污染無菌室。微生物極限室的樣品含有細(xì)菌。污染無菌室后，產(chǎn)品可能出現(xiàn)假陽性結(jié)果?？股鼐哂锌咕阅堋Ｎ廴緹o菌室后，產(chǎn)品可能出現(xiàn)假陰性結(jié)果。這樣，無法保證無菌檢測結(jié)果的真實性，無法調(diào)查超標(biāo)結(jié)果，無菌檢測將失去意義、
由于回風(fēng)系統(tǒng)設(shè)置不合理，壓差無法調(diào)整。不同的實驗室共用一個夾墻，這將導(dǎo)致實驗室之間的交叉污染。對于所需的無菌環(huán)境（如無菌檢查室和微生物限制檢查室），應(yīng)保持相對正壓，以防止細(xì)菌區(qū)域的空氣污染。污染源（如陽性控制室、抗生素微生物檢定室）應(yīng)保持相對負(fù)壓，防止污染物的擴散影響實驗結(jié)果和人員安全。